Bonjour,
Non, l'arrêt de travail ne suspend pas le licenciement et tant que celui-ci ne vous a pas été notifié, vous percevrez les IJ de la CPAM. Il n'y aura normalement pas de trop perçu, mais surveillez bien les dates.
Renseignez vous auprès de votre caisse pour une pension d'invalidité qui pourrait prendre le relais.
https://www.service-public.fr/particuliers/vosdroits/F672