Malheureusement, vous ne pouvez pas faire grand chose... D'après les informations que vous donnez, l'association a tout à fait le droit de rompre votre contrat, d'autant qu'elle est dans une situation difficile.
Mais cela ne devrait pas remettre en question le financement de votre formation par AGEFOS...
Sinon, il me semble qu'il existe des formations en ligne très abordables. Pour ma part c'est ce que j'ai fais pour ma formation en comptabilité. J'ai trouvé mon organisme sur ce site :
http://www.educadis.fr/ en si cela peut vous aider